Tuy nhiên, công tác tưới tiêu cho hoạt động sản xuất nông nghiệp vẫn còn nhiều khó khăn, tình hình khí tượng thuỷ văn diễn biến phức tạp trong nhiều năm đã gây bất lợi cho công tác sản xuất, phòng chống lụt bão, thời gian vận hành các trạm bơm tưới tiêu phát sinh làm tăng chi phí hoạt động của doanh nghiệp. Đặc biệt, hiện nay hơn 40% công trình thuỷ lợi được xây dựng trước năm 1970, hơn 75% công trình xây dựng trước năm 1990 nên nhiều trạm bơm đã xuống cấp, lạc hậu. Việc vi phạm pháp lệnh quản lý khai thác bảo vệ công trình thuỷ lợi, tình trạng đổ rác thải, phê thải xuống kênh mương diễn ra nhiều. Số vụ được xử lý giải toả còn ít hơn số vụ phát sinh, làm tăng tổng số vụ vi phạm công trình thuỷ lợi, ảnh hưởng đến công tác quản lý, khai thác phục vụ sản xuất của các doanh nghiệp.

Phát biểu tại hội nghị, Phó Chủ tịch Trần Xuân Việt đánh giá Chi cục Thuỷ lợi Hà Nội đã bám sát chức năng nhiệm vụ thành phố giao, thực hiện tốt nhiệm vụ sản xuất nông nghiệp, đảm bảo năng suất của vụ mùa, vụ xuân. Theo Phó chủ tịch, để giải quyết vấn đề vi phạm liên quan đến công trình thuỷ lợi, các đơn vị cần khẩn trương cắm mốc, chỉ giới cho các công trình thuỷ lợi, hệ thống mương máng nhằm hạn chế những vi phạm về xâm lấn hành lang đê điều thuỷ lợi.

Về công tác phối hợp với các quận, huyện, Chi cục cần có những giải pháp từng bước hạn chế những yếu kém, hoàn chỉnh vấn đề phân cấp các công trình thuỷ lợi, xây dựng các tiêu chí ở cấp xã, phường, quận huyện tạo sự thống nhất quản lý, nêu cao tính trách nhiệm.

Bên cạnh đó, Chi cục cũng cần khắc phục tồn tại về việc cấp nước mới chỉ dừng lại ở việc cấp nước cho lúa, chưa quan tâm đến việc bố trí nguồn nước cho các cây trồng giá trị kinh tế cao khác, như rau, cây ăn quả, các vùng sản xuất lớn cần nước. Đặc biệt, chú trọng việc cải tiến phương pháp công tác tưới tiêu, tính dự đoán các chi phí phát sinh trong việc tiêu, úng, tránh việc sử dụng lãng phí nguồn nước, nguồn điện, nhân lực của các doanh nghiệp thuỷ lợi.