Tham mưu, giúp Giám đốc Sở thực hiện chức năng quản lý nhà nước trong công tác quy hoạch, kế hoạch và đầu tư của Ngành; quản lý, thực hiện công tác tài chính, kế toán, tài sản trong ngành theo các quy định hiện hành của Nhà nước và của thành phố Hà Nội.

Tham mưu, giúp Giám đốc Sở quản lý, thực hiện về tổ chức bộ máy; công tác cán bộ; các chế độ chính sách đối với cán bộ, công nhân viên chức trong ngành theo thẩm quyền. Bảo vệ chính trị nội bộ; an ninh kinh tế, giáo dục quốc phòng; dân quân tự vệ trong ngành theo các quy định ...

Tham mưu, giúp Giám đốc Sở thực hiện công tác hành chính, quản trị; tổng hợp; thông tin tuyên truyền,... theo các quy định hiện hành của Nhà nước và của thành phố Hà Nội.

Tham mưu, giúp Giám đốc Sở thực hiện quản lý Nhà nước về công tác quản lý xây dựng công trình theo các quy định hiện hành của Nhà nước và của UBND thành phố Hà Nội.

Ngày 15/12/2023, UBND Thành phố Hà Nội ban hành Quyết định số 30/QĐ-UBND về việc quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn thành phố Hà Nội