Thực hiện quyết định của Thủ tướng Chính phủ, UBND TP Hà Nội đã phê duyệt kế hoạch thực hiện Chương trình mục tiêu Quốc gia khắc phục ô nhiễm và cải thiện môi trường thành phố Hà Nội giai đoạn 2012-2015. Trong năm 2012, UBND TP đã chỉ đạo tiến hành khảo sát, thống kê sơ bộ các điểm ô nhiễm tồn lưu hoá chất bảo vệ thực vật trên địa bàn thành phố và đánh giá mức độ ô nhiễm môi trường tại 3 khu vực gồm chợ Nhông (huyện Ba Vì), Vân Đình (huyện Ứng Hoà) và Xuân Nộn (huyện Đông Anh) tồn lưu hoá chất bảo vệ thực vật bị ô nhiễm nghiêm trọng dựa trên cơ sở kết quả điều tra, khảo sát. Năm 2013, tiếp tục tiến hành điều tra, khảo sát chi tiết phạm vi, mức độ ô nhiễm hoá chất bảo vệ thực vật tại 2 điểm ô nhiễm tồn lưu hoá chất bảo vệ thực vật là kho Chùa Cao (huyện Ba Vì) và kho Phụng Thượng (huyện Phúc Thọ).

Liên quan đến việc triển khai các dự án xử lý ô nhiễm môi trường do hoá chất bảo vệ thực vật tồn lưu, ngày 23/10/2013, UBND TP Hà Nội đã có văn bản chỉ đạo Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tiến hành xử lý ô nhiễm môi trường đất do hoá chất bảo vệ thực vật tại trạm bảo vệ thực vật, huyện Thanh Oai. Cụ thể, diện tích đất ô nhiễm đã xử lý 509,42m2, công nghệ xử lý tại chỗ bằng hoá chất. Trước và sau khi xử lý, Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn đã tiến hành quan trắc, đánh giá môi trường đất, kết quả hiệu lực xử lý đạt 95%. Việc xử lý ô nhiễm môi trường đất do hoá chất bảo vệ thực vật bằng phương pháp xử lý tại chỗ, chi phí thấp hơn so với phương pháp vận chuyển đất bị ô nhiễm đi tiêu huỷ bằng lò đốt đa cấp.

Giai đoạn từ nay đến hết năm 2014, UBND TP Hà Nội đã giao Sở Tài nguyên và Môi trường tiến hành đánh giá mức độ ô nhiễm môi trường tại các điểm tồn lưu hoá chất bảo vệ thực vật, triển khai đánh giá, phân loại và xử lý một số điểm tồn lưu ô nhiễm nghiêm trọng nhất. Việc triển khai các dự án xử lý ô nhiễm môi trường do hoá chất bảo vệ thực vật tồn lưu sẽ được thực hiện vào năm 2015.